马红球菌探针法荧光定量PCR检测试剂盒使用方法
发表时间:2024-03-14
马红球菌探针法荧光定量PCR检测试剂盒使用方法:
1. 样品处理(样本处理区)
1.1 样本前处理
按照试剂盒操作说明或者微生物样品处理方法做好样品前处理。
1.2 DNA 提取
根据您实验室的具体情况和样品类型,选择适当的提取策略方法。为了使实验结果稳定、有效、可靠,我们建议使用商品化的试剂盒进行提取,严格按照对应试剂盒说明书进行操作,样本核酸提取过程中应避免污染,提取好的模板样品如不能立即检测,建议-15℃以下保存。
推荐采用我们公司研发生产的试剂盒:Hypure 病毒基因组 DNA 提取试剂盒
2. 试剂配制(试剂准备区)
2.1 从-15℃以下冰箱中取出试剂盒平衡到室温(20~25℃),注意避免强光照射,待完全溶解后振荡混匀并低速离心 10 s,使用低吸附吸头分液取样,避免试剂损失和浪费。
2.2 根据待检测样本总数,设所需要的 PCR 反应管管数为 N(N=样本数+1 管阴性对照+1 管阳性对照;样品每满 7 份,多配制 1 份),每测试反应体系配制如下表:
试剂
鲑肾杆菌反应液
鲑肾杆菌扩增液
用量(样本数为N)
19.5μL
0.5μL
2.3 在适当容积的无菌离心管中加入上述试剂,充分振荡混匀后 2000 rpm 离心 10 s,按照 20 μL/管分装量将试剂分装至八联 PCR 反应管中。
2.4 盖紧八联 PCR 反应管盖, 并注意做好相应标识(请标记在八联 PCR 反应管盖两端突出部位,切勿标记在八联 PCR 反应管盖中间,以免影响信号采集)。将 PCR 反应管转移至样本准备区,剩余试剂放回-15℃以下冰箱冷冻保存。
3. 加样(样本处理区)
将步骤 1.2 提取的 DNA、阳性质控品、阴性质控品各取 5μL,分别加入相应的反应管中,盖好管盖,混匀,短暂离心,核酸加样过程中应避免污染。
4. PCR 扩增(核酸扩增区)
4.1 将待检测反应管置于荧光定量 PCR 仪反应槽内, 并记录放置顺序。
4.2 设置好通道、样品信息,反应体系设置为 25 μL;
荧光通道选择:检测通道选择 FAM, 淬灭通道选择 NONE,参比荧光选 NONE。
4.4 推荐循环参数设置:
步骤
循环数
温度
时间
收集荧光信号
1
1 cycle
95℃
3min
否
2
40 cycle
95℃
15sec
否
55℃
30sec
否
5. 结果分析判定
5.1 结果分析条件设定
设置 Baseline 和 Threshold:一般直接按机器自动分析的结果分析,当曲线出现整体倾斜时,根据分析后图像调节 Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范围内调节)、stop 值(一般可在 5~20 范围内调节),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖动阈值线至高于阴性对照),重新分析结果。
5.2 结果判断
阳性:检测通道 Ct 值≤35.0,且曲线有明显的指数增长曲线。
可疑:检测通道 Ct 值>35.0,且出现典型扩增曲线的样本建议重复试验,重复试验结果出现 Ct 值≤38.0 和典型扩增曲线者为阳性,否则为阴性。
阴性:检测结果 Ct 值无 Ct 值,无明显的扩增曲线。
6. 质控标准
阴性质控品:无明显扩增曲线或无 Ct 值显示;
阳性质控品:扩增曲线有明显指数生长期,且 Ct 值≤30;
以上条件应同时满足,否则实验视为无效。
7. 产品性能指标
阴阳性参考品符合率:5 份阳性参考品符合率为 100%;10 份阴性参考品符合率为 100%。
最低检测限:1.0×103copies/mL。
精密度:批内、批间精密度检测 Ct 值的变异系数(CV)均小于等于 3%。
8. 检测方法的局限性
样本检测结果与样本收集、处理、运送以及保存质量有关;
样本提取过程中没有控制好交叉污染,会出现假阳性结果;
阳性对照、扩增产物泄漏,会导致假阳性结果;
病原体在流行过程中基因突变、重组,会导致假阴性结果;
不同的提取方法存在提取效率差异,会导致假阴性结果;
试剂运输,保存不当或试剂配制不准确引起的试剂检测效能下降,出现假阴性或定量检测不准确的结果;
本检测结果仅供参考,如须确诊请结合临床症状以及其他检测手段。